De diagnostiek naar een influenzavirus infectie berust op het direct aantonen van influenzavirus in respiratoir materiaal. De meest sensitieve bepaling hiervoor is de PCR-bepaling en dit is inmiddels de standaardbepaling voor het aantonen van een influenzavirus infectie.
De PCR op influenzavirus zit in het standaard pakket voor respiratoire diagnostiek, welke ook typeert voor influenza type A H1, H1pdm09, H3 en type B.
Door moleculaire technieken zoals PCR is de rol van serologische technieken steeds meer op de achtergrond gekomen. Serologie ten tijde van een recente infectie heeft weinig directe consequenties voor het klinisch beleid en wordt op ons laboratorium niet meer uitgevoerd.