Voor aantonen van verwekkers van gastro-enteritis is in de meest gevallen de PCR de belangrijkste methode. Bij verdenking op gastro-enteritis wordt geadviseerd om het gastro-enteritis pakket aan te vragen. Dit is een multiplex PCR met daarin de volgende targets: Adenovirus type 40/41, Astrovirus, Norovirus, Rotavirus, Sapovirus, Campylobacter spp, C. difficile toxine A/B, Shigella spp/EIEC, Plesiomonas shigelloides, Salmonella spp, Shiga-toxine vormende E. coli, Vibrio vulnificus, Vibrio parahaemolyticus, Vibrio cholerae, Yersinia enterocolitica, Cryptosporidium spp, Cyclospora cayetanensis, Entamoeba histolytica, Giardia lamblia.
Uitslagen van materialen ontvangen binnen de openingstijden van het laboratorium virologie zijn dezelfde dag of uiterlijk de volgende ochtend bekend. Het gastro-enteritis pakket wordt De diagnostiek wordt uitgevoerd op werkdagen tussen 8.00 uur en 16.30 uur. Resultaten zijn dezelfde dag of de volgende ochtend beschikbaar. In het weekend wordt alleen de Clostridium PCR sneltest ingezet.
Nota bene:
- Bij kinderen <2 jaar wordt het resultaat van de Clostrioides difficile uitslag van de multiplex PCR niet gerapporteerd.
- Bij nosocomiale gastro-enteritis is Clostridioides difficile de belangrijkste verwekker. Hierop kan specifiek worden aangevraagd. Bij een aanvraag op zowel gastro-eneritis als Clostridium wordt op weekdagen alleen het gastro-enteritis pakket ingezet.
- Bij een positieve PCR op kweekbare verwekkers zal kweek met resistentiebepaling volgen.
- Het is niet mogelijk op alle gastro-intestinale parasieten met PCR te testen. Bij sterke verdenking blijft daarom de mogelijkheid van microscopisch en serologisch parasitologisch onderzoek. De betekenis van Dientamoeba fragilis en Blastocystis spp. is zeer discutabel. Daarom wordt standaard onderzoek naar deze twee protozoa niet verricht.